Das NFP hat den Auftrag, Methoden und Strategien für ein kontinuierliches Überwachungssystem zu entwickeln und eine Übersicht über die gegenwärtige Situation der Antibiotikaresistenz in der Schweiz bei Bakterien, die von Mensch und Tier, aus der Landwirtschaft, aus Lebensmitteln und aus der Umwelt herstammen, zu erstellen. Die Mobilität von resistenten Bakterien und Resistenzgenen und die daraus resultierende Gefahr für zukünftige Therapien soll evaluiert werden. Die sozialen, rechtlichen, ethischen und wirtschaftlichen Konsequenzen der Bildung von Resistenzen auf Antibiotika und einer allfälligen Neureglementierung des Antibiotikaeinsatzes sollen abgeschätzt werden.

Für die Durchführung dieses multidisziplinären Programms steht ein Betrag von 12 Millionen Franken für die Dauer von 5 Jahren zur Verfügung.

Die Forschungsphase des NFP 49 hat am 1. Juli 2001 begonnen. 21 Forschungsgruppen haben bereits ihre Arbeit aufgenommen. Die bewilligten Projekte organisieren sich innerhalb des NFP Antibiotikaresistenz in den drei Gruppen:

• Human- und Veterinärmedizin, Überwachung und Umwelt
• Molekularbiologie
• Gesellschaft, Recht und Wirtschaft

Im Juli 2003 wurde die Zweitausschreibung lanciert, welche insbesondere auch die vorhandenen Lücken zu füllen erhofft. Start der Forschung dieser Projekte ist der 1. Juli 2004. Alle Projekte im NFP 49 sollten bis Ende Juni 2006 abgeschlossen werden.